و ذهب بعض المؤرخین إلى أنها توفیت فی یثرب، و دفنت فی بقیع الغرقد، و یواجه هذا القول إنها لو دفنت هناک لکان لها مرقد خاص، کما هو الحال فی غیرها من السادة المعظمین من أبناء الاسرة النبویة، و من المحتمل أنها أوصت أن تدفن فی غلس اللیل البهیم، و یعفى موضع قبرها تأسیا بامها زهراء الرسول صلى الله علیه و آله.
در پرتو عنایت خداوند متعال و توجهات حضرت ولیعصر (عج) و پیرو تاکید مقام معظم رهبری بر تلاش در عرصه نوسازی و اعتلای پژوهش‌های دینی و اسلامی با حداکثر استفاده از روش‌ها و ابزارهای جدید به امر مرجع عالیقدر حضرت آیه الله العظمی مظاهری دامت برکاته در آذرماه سال ۱۳۷۷ تاسیس شده است.
تا کنون گام‌های موثر و چشمگیری در راستای پیشبرد و اعتلای پژوهش‌های اسلامی برداشته که علاوه بر تولید ده‌ها نرم‌افزار دینی، به تحقیق و انتشار کتب مفیدی دست زده است که تاثیر این تحول بنیادی مورد توجه و قبول عالمان، محققان و اندیشمندان جامعه اسلامی قرار گرفته است و تاکنون توانسته رتبه‌های متعددی از جمله خادم قرآن کریم (۱۳۸۴) و خادم فرهنگ عمومی (۱۳۸۶) کسب نماید.
