از هنگام بناى جامع اموى، در قرون مختلف، تعمیرات و اصلاحاتى در آن انجام گرفته و گاهى نیز توسعه یافته است. از جمله:
1. سال 160 هـ. ق. – ساخت گنبد شرقى در صحن (صخره ی قربان(.
2. سال 172 هـ. ق. – ساخت گنبد غربى به نام قبّة المال.
3. سال 396 هـ. ق. – ساخت گنبد نوفره مقابل باب جیرون (باب ساعات(.
4. سال 475 هـ. ق. -تعمیر گنبدها و طاقها در ایام پادشاه سلجوقى تتش بن آلب ارسلان.
5. سال 503 هـ. ق. – تعمیر رواق شمالى.
6. سال 555 هـ. ق. – تجدید مناره ی عروس.
7. سال 565 هـ. ق. – اصلاح و تجدید داخل.
8. سال 602 هـ. ق. – سنگفرش مرمر کف مسجد.
9. سال 607 هـ. ق. – تعمیر درهاى جامع اموى.
10. سال 607 هـ. ق. -فواره ی مسجد.
11. سال 613 هـ. ق. – ترمیم قبه ی نسر (عقاب(.
12. سال 614 هـ. ق. – اتمام شبستانهاى داخلى.
13. سال 617 هـ. ق. – ساخت محرابى براى حنبلىها در رواق سوم (غربى) در داخل شبستان، که اکنون موجود است.
14. سال 668 هـ. ق. – تعمیر و سنگ مرمر ستونها و دیوارها.
15. سال 727 هـ. ق. – تزیین دیوار شمالى جامع با سنگ مرمر.
16. سال 729 هـ. ق. – تزیین دیوار قبله جامع با سنگ مرمر.(1)
1) نک: نعیمی، الجامع الاموی، ص 128 ـ 122؛ اکرم العلبی، همان کتاب، ص 289 ـ 290.